于是，神界因灵力最强被称为“三皇”的伏羲、女娲、神农合三人之力，将大地上的五种灵力凝结成五灵珠，用灵珠的能量束缚天，令其不能远离大地。使神界能够继续从大地获得灵力的供给，而结果却是灵力都被灵珠吸纳，大地本身因灵力过度消耗而趋于崩解。三皇只得还灵珠于地脉，令其维持住大地的形态。但是，由于灵力已经被聚集，大地原本的面貌失衡，原本是处处山明水秀的大地，因受到灵珠地脉的影响，有些地方严寒而有些地方酷暑，水、火之灾常常发生。五灵环环相克，生生不息，构成天地间力的源泉。
随之时间的推移，千年之后的蚩尤开始叛乱，率兽等对付女娲所造的人，神族派神将轩辕氏和招唤五灵神对付蚩尤,后五灵神不愿返回灵珠内,神界派女娲将其封印。灵珠拥有着世间最强大的五种灵力.倘若五灵连珠其力可吞日月,逆乾坤.然五灵久聚一起反而会破坏世间原有的生态秩序,引起大地原本的面貌失衡，原本是处处山明水秀的大地，因受到灵珠地脉的影响，有些地方严寒而有些地方酷暑，水、火之灾常常发生。
所以女娲在封印五灵神后施法将其分散在世间各地,以维持天地阴阳之平衡.五灵连珠只是利用了五灵合一那种吞日月,逆乾坤的力量罢了,并不是把五灵珠永远的聚在一起.当五灵珠的力量被利用后,为维持天地阴阳之平衡.五灵珠内被女娲所施的咒语再次启动将五灵珠送往各地。
然而，女娲后人传到巫后那一代时，发生了一些变故，五颗灵珠遗落各地，被一些妖怪给拾去占有了。历史上曾出现过，但自从到了元朝，便不知所踪。